Rozdíl mezi těma CD je, že Desktop je Live CD s grafickým instalátorem. Ten ale není ještě moc doladěnej (je tam až od 6.06, dřív byl jenom textový).
Alternate CD má klasický debianovský textový instalátor, přes který toho jde nastavit trochu víc a nemá takový chyby. Možná by povolil instalovat i na menší disky, to by se muselo zkusit. Navíc přes alternate CD jde systém aktualizovat ze starších verzí, je tam volba server (neinstaluje se grafika, ale nějaký balíky pro server) a myslím ještě něco...

Možná by byl ještě dobrý DSL (Damn Small Linux), ale to je takovej spíš pro starší PC...celkem na nic...ale jede to na Pentiu 133MHz, 32MB RAM